| 発生時刻 | 震源地 | 最大震度 | 地震の規模 | 深さ |
|---|---|---|---|---|
| 2016年6月3日8:30頃 | 熊本中央区 | 1 | M 2.3 | 10.0km |
| 2016年6月3日8:25頃 | 山都町 | 2 | M 3.0 | 10.0km |
| 2016年6月3日8:07頃 | みやま市 | 1 | M 3.2 | 10.0km |
| 2016年6月3日7:58頃 | 熊本西区 | 3 | M 3.7 | 10.0km |
| 2016年6月3日6:45頃 | 熊本中央区 | 1 | M 2.3 | 10.0km |
| 2016年6月3日0:53頃 | 銚子市 | 1 | M 4.2 | 40.0km |
| 2016年6月3日0:40頃 | 球磨村 | 1 | M 2.1 | 10.0km |
| 2016年6月2日22:35頃 | 長南町 | 3 | M 3.7 | 30.0km |
| 2016年6月2日21:12頃 | 熊本中央区 | 2 | M 2.3 | 10.0km |
| 2016年6月2日21:07頃 | 熊本中央区 | 2 | M 2.5 | 10.0km |
| 2016年6月2日19:37頃 | 熊本中央区 | 1 | M 2.0 | - km |
| 2016年6月2日18:36頃 | 茂原市 | 3 | M 3.9 | 30.0km |
| 2016年6月2日18:05頃 | 八代市 | 2 | M 2.5 | - km |
| 2016年6月2日16:44頃 | 阿蘇市 | 3 | M 3.3 | 10.0km |
| 2016年6月2日16:07頃 | 熊本西区 | 2 | M 3.0 | 10.0km |
| 2016年6月2日11:37頃 | 熊本西区 | 1 | M 2.3 | 10.0km |
| 2016年6月2日11:27頃 | 宇城市 | 1 | M 2.2 | - km |
| 2016年6月2日10:44頃 | 熊本西区 | 1 | M 2.5 | 10.0km |
| 2016年6月1日4:41頃 | 日立市 | 1 | M 2.5 | 10.0km |
| 2016年6月1日3:30頃 | 阿蘇市 | 1 | M 2.8 | 10.0km |